Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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Cln5Q3UMW8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Cln5Q3UMW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln5Q3UMW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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