Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc4Q3UMB9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc4Q3UMB9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms