Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc33Q3ULW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms