Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrxosQ3UL53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrxosQ3UL53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms