Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3UJP5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3UJP5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3UJP5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UJP5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3UJP5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UJP5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms