Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc34Q3UI66 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms