Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx27Q3UHD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms