Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms