Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Puf60Q3UEB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Puf60Q3UEB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms