Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem109Q3UBX0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms