Protein–RNA interactions for Protein: Q3U962

Col5a2, Collagen alpha-2(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a2Q3U962 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col5a2Q3U962 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col5a2Q3U962 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a2Q3U962 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a2Q3U962 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms