Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl21Q3U410 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms