Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem35bQ3U0Y2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms