Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Palb2Q3U0P1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms