Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4clQ3TYX2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Lrrn4clQ3TYX2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn4clQ3TYX2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.1 ms