Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm2Q3TWN3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm2Q3TWN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnnm2Q3TWN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm2Q3TWN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm2Q3TWN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms