Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc136Q3TVA9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Ccdc136Q3TVA9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ccdc136Q3TVA9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms