Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3TTL0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3TTL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms