Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTJ4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTJ4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTJ4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms