Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms