Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TQQ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TQQ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms