Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms