Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afvQ3THW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afvQ3THW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms