Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms