Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stt3bQ3TDQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stt3bQ3TDQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stt3bQ3TDQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms