Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc127Q3TC33 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms