Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd8Q3TA59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms