Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd2bQ3T9M1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd2bQ3T9M1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms