Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms