Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col24a1Q30D77 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col24a1Q30D77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms