Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax1Q2NKI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms