Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo3bQ1EG27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo3bQ1EG27 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms