Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ttc39dQ0VF76 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ttc39dQ0VF76 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Ttc39dQ0VF76 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ttc39dQ0VF76 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc39dQ0VF76 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ttc39dQ0VF76 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc39dQ0VF76 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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