Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samd12Q0VE29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms