Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms