Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SobpQ0P5V2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SobpQ0P5V2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SobpQ0P5V2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms