Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r181Q0P547 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms