Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrioQ0KL02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TrioQ0KL02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms