Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cass4Q08EC4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms