Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ssrp1Q08943 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms