Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff1Q08423 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms