Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms