Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb2Q08331 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb2Q08331 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms