Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Pou6f1Q07916 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou6f1Q07916 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms