Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ebf1Q07802 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms