Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrstQ06666 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrstQ06666 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms