Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Caprin2Q05A80 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms