Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcst1Q059Y8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dcst1Q059Y8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms