Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox9Q04887 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox9Q04887 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms