Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms